Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A6P48664 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A6P48664 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A6P48664 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms