Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARCN1P48444 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms