Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRB2P47870 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRB2P47870 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRB2P47870 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms