Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRCC3P46736 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRCC3P46736 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms