Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSKP43235 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSKP43235 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSKP43235 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSKP43235 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSKP43235 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSKP43235 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSKP43235 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSKP43235 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSKP43235 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSKP43235 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSKP43235 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSKP43235 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSKP43235 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSKP43235 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSKP43235 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSKP43235 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSKP43235 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSKP43235 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSKP43235 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSKP43235 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSKP43235 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSKP43235 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSKP43235 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSKP43235 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSKP43235 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSKP43235 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSKP43235 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSKP43235 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSKP43235 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSKP43235 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSKP43235 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSKP43235 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSKP43235 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSKP43235 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSKP43235 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSKP43235 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSKP43235 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSKP43235 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSKP43235 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSKP43235 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSKP43235 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSKP43235 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSKP43235 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSKP43235 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSKP43235 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSKP43235 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSKP43235 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSKP43235 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSKP43235 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSKP43235 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSKP43235 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSKP43235 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSKP43235 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSKP43235 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSKP43235 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSKP43235 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSKP43235 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSKP43235 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSKP43235 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSKP43235 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSKP43235 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSKP43235 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSKP43235 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSKP43235 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSKP43235 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSKP43235 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSKP43235 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSKP43235 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSKP43235 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSKP43235 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSKP43235 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSKP43235 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSKP43235 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSKP43235 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSKP43235 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSKP43235 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSKP43235 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTSKP43235 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTSKP43235 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSKP43235 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSKP43235 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSKP43235 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSKP43235 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSKP43235 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSKP43235 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSKP43235 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSKP43235 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSKP43235 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSKP43235 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSKP43235 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSKP43235 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSKP43235 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSKP43235 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSKP43235 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSKP43235 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSKP43235 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSKP43235 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSKP43235 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSKP43235 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms