Protein–RNA interactions for Protein: P42773

CDKN2C, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2CP42773 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2CP42773 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN2CP42773 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms