Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP3P42574 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP3P42574 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP3P42574 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP3P42574 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP3P42574 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP3P42574 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP3P42574 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP3P42574 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP3P42574 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP3P42574 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP3P42574 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP3P42574 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP3P42574 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP3P42574 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP3P42574 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP3P42574 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP3P42574 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP3P42574 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP3P42574 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP3P42574 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP3P42574 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP3P42574 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP3P42574 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP3P42574 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP3P42574 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP3P42574 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP3P42574 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP3P42574 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP3P42574 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP3P42574 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP3P42574 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP3P42574 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASP3P42574 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP3P42574 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP3P42574 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP3P42574 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP3P42574 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP3P42574 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP3P42574 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP3P42574 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP3P42574 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP3P42574 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP3P42574 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP3P42574 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP3P42574 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP3P42574 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP3P42574 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP3P42574 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP3P42574 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP3P42574 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP3P42574 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP3P42574 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP3P42574 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP3P42574 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP3P42574 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP3P42574 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP3P42574 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP3P42574 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP3P42574 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP3P42574 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP3P42574 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP3P42574 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP3P42574 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP3P42574 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP3P42574 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP3P42574 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP3P42574 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP3P42574 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP3P42574 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP3P42574 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP3P42574 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP3P42574 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP3P42574 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP3P42574 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP3P42574 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP3P42574 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP3P42574 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP3P42574 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP3P42574 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASP3P42574 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP3P42574 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP3P42574 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP3P42574 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP3P42574 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP3P42574 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP3P42574 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP3P42574 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP3P42574 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP3P42574 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP3P42574 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP3P42574 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP3P42574 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP3P42574 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP3P42574 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP3P42574 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP3P42574 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP3P42574 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP3P42574 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP3P42574 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms