Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CBP42338 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms