Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGCXP38435 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGCXP38435 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGCXP38435 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGCXP38435 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGCXP38435 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGCXP38435 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGCXP38435 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGCXP38435 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGCXP38435 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGCXP38435 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGCXP38435 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GGCXP38435 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGCXP38435 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGCXP38435 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGCXP38435 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGCXP38435 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGCXP38435 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGCXP38435 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGCXP38435 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGCXP38435 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGCXP38435 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGCXP38435 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGCXP38435 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGCXP38435 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGCXP38435 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGCXP38435 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGCXP38435 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGCXP38435 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGCXP38435 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGCXP38435 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGCXP38435 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGCXP38435 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGCXP38435 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGCXP38435 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GGCXP38435 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGCXP38435 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGCXP38435 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGCXP38435 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGCXP38435 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGCXP38435 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGCXP38435 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GGCXP38435 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGCXP38435 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGCXP38435 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGCXP38435 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGCXP38435 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGCXP38435 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGCXP38435 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGCXP38435 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGCXP38435 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGCXP38435 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGCXP38435 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGCXP38435 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGCXP38435 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGCXP38435 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGCXP38435 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGCXP38435 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGCXP38435 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGCXP38435 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGCXP38435 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGCXP38435 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGCXP38435 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGCXP38435 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGCXP38435 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGCXP38435 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGCXP38435 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGCXP38435 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGCXP38435 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGCXP38435 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGCXP38435 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GGCXP38435 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGCXP38435 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGCXP38435 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGCXP38435 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGCXP38435 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGCXP38435 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGCXP38435 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGCXP38435 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGCXP38435 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGCXP38435 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GGCXP38435 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGCXP38435 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGCXP38435 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGCXP38435 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGCXP38435 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGCXP38435 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGCXP38435 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGCXP38435 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGCXP38435 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GGCXP38435 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGCXP38435 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GGCXP38435 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGCXP38435 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGCXP38435 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGCXP38435 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GGCXP38435 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGCXP38435 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGCXP38435 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGCXP38435 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms