Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYH11P35749 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYH11P35749 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYH11P35749 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYH11P35749 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYH11P35749 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYH11P35749 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYH11P35749 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYH11P35749 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYH11P35749 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYH11P35749 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYH11P35749 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYH11P35749 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MYH11P35749 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYH11P35749 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYH11P35749 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYH11P35749 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYH11P35749 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYH11P35749 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYH11P35749 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYH11P35749 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MYH11P35749 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYH11P35749 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MYH11P35749 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYH11P35749 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYH11P35749 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH11P35749 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH11P35749 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH11P35749 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH11P35749 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH11P35749 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH11P35749 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH11P35749 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH11P35749 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH11P35749 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH11P35749 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH11P35749 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH11P35749 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH11P35749 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH11P35749 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH11P35749 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH11P35749 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH11P35749 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH11P35749 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH11P35749 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH11P35749 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH11P35749 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH11P35749 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH11P35749 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH11P35749 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH11P35749 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH11P35749 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH11P35749 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH11P35749 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYH11P35749 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYH11P35749 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYH11P35749 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYH11P35749 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYH11P35749 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYH11P35749 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYH11P35749 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH11P35749 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH11P35749 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH11P35749 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH11P35749 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH11P35749 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH11P35749 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH11P35749 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH11P35749 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH11P35749 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH11P35749 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH11P35749 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH11P35749 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYH11P35749 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYH11P35749 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYH11P35749 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYH11P35749 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYH11P35749 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYH11P35749 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH11P35749 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH11P35749 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH11P35749 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH11P35749 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH11P35749 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH11P35749 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH11P35749 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH11P35749 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH11P35749 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYH11P35749 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYH11P35749 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYH11P35749 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYH11P35749 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MYH11P35749 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYH11P35749 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYH11P35749 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYH11P35749 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYH11P35749 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYH11P35749 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYH11P35749 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYH11P35749 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms