Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HNF1BP35680 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HNF1BP35680 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms