Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT9P35527 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT9P35527 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT9P35527 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT9P35527 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT9P35527 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT9P35527 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT9P35527 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT9P35527 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT9P35527 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT9P35527 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT9P35527 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT9P35527 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT9P35527 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT9P35527 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT9P35527 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT9P35527 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT9P35527 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT9P35527 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT9P35527 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT9P35527 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT9P35527 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT9P35527 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT9P35527 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT9P35527 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT9P35527 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT9P35527 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT9P35527 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT9P35527 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT9P35527 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT9P35527 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT9P35527 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT9P35527 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT9P35527 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT9P35527 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT9P35527 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT9P35527 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT9P35527 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT9P35527 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT9P35527 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT9P35527 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT9P35527 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT9P35527 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT9P35527 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT9P35527 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT9P35527 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT9P35527 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT9P35527 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT9P35527 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT9P35527 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT9P35527 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT9P35527 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT9P35527 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT9P35527 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT9P35527 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT9P35527 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT9P35527 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT9P35527 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT9P35527 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT9P35527 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT9P35527 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT9P35527 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT9P35527 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT9P35527 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT9P35527 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT9P35527 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT9P35527 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT9P35527 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT9P35527 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT9P35527 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT9P35527 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT9P35527 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT9P35527 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT9P35527 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT9P35527 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT9P35527 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT9P35527 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT9P35527 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT9P35527 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT9P35527 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT9P35527 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT9P35527 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT9P35527 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT9P35527 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT9P35527 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT9P35527 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT9P35527 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT9P35527 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT9P35527 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT9P35527 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT9P35527 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT9P35527 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT9P35527 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT9P35527 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT9P35527 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT9P35527 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT9P35527 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT9P35527 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT9P35527 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT9P35527 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms