Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBSP35520 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CBSP35520 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBSP35520 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBSP35520 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBSP35520 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBSP35520 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBSP35520 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBSP35520 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBSP35520 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBSP35520 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBSP35520 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBSP35520 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBSP35520 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CBSP35520 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBSP35520 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBSP35520 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBSP35520 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBSP35520 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBSP35520 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBSP35520 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CBSP35520 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBSP35520 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBSP35520 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBSP35520 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBSP35520 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBSP35520 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBSP35520 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CBSP35520 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBSP35520 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBSP35520 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBSP35520 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBSP35520 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBSP35520 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBSP35520 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBSP35520 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CBSP35520 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBSP35520 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBSP35520 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBSP35520 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBSP35520 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CBSP35520 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBSP35520 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBSP35520 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBSP35520 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBSP35520 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBSP35520 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBSP35520 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBSP35520 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBSP35520 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBSP35520 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBSP35520 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CBSP35520 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBSP35520 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBSP35520 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBSP35520 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBSP35520 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBSP35520 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBSP35520 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBSP35520 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBSP35520 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBSP35520 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBSP35520 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBSP35520 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBSP35520 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBSP35520 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBSP35520 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBSP35520 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBSP35520 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBSP35520 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBSP35520 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBSP35520 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBSP35520 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBSP35520 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBSP35520 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBSP35520 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBSP35520 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBSP35520 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBSP35520 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBSP35520 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBSP35520 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBSP35520 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBSP35520 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBSP35520 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBSP35520 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms