Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD12P35452 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD12P35452 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD12P35452 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms