Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THBS4P35443 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
THBS4P35443 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
THBS4P35443 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
THBS4P35443 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
THBS4P35443 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
THBS4P35443 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
THBS4P35443 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THBS4P35443 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THBS4P35443 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THBS4P35443 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THBS4P35443 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THBS4P35443 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
THBS4P35443 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
THBS4P35443 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
THBS4P35443 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THBS4P35443 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THBS4P35443 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THBS4P35443 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
THBS4P35443 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THBS4P35443 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THBS4P35443 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THBS4P35443 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THBS4P35443 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
THBS4P35443 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THBS4P35443 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THBS4P35443 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THBS4P35443 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THBS4P35443 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THBS4P35443 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THBS4P35443 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THBS4P35443 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THBS4P35443 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THBS4P35443 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THBS4P35443 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THBS4P35443 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THBS4P35443 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THBS4P35443 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THBS4P35443 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THBS4P35443 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THBS4P35443 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THBS4P35443 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THBS4P35443 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THBS4P35443 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THBS4P35443 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
THBS4P35443 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
THBS4P35443 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THBS4P35443 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
THBS4P35443 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
THBS4P35443 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
THBS4P35443 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
THBS4P35443 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
THBS4P35443 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
THBS4P35443 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
THBS4P35443 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
THBS4P35443 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
THBS4P35443 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
THBS4P35443 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
THBS4P35443 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
THBS4P35443 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
THBS4P35443 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
THBS4P35443 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
THBS4P35443 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
THBS4P35443 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
THBS4P35443 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
THBS4P35443 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
THBS4P35443 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
THBS4P35443 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
THBS4P35443 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
THBS4P35443 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
THBS4P35443 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
THBS4P35443 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
THBS4P35443 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
THBS4P35443 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
THBS4P35443 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
THBS4P35443 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
THBS4P35443 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
THBS4P35443 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THBS4P35443 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THBS4P35443 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THBS4P35443 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THBS4P35443 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THBS4P35443 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THBS4P35443 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
THBS4P35443 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THBS4P35443 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THBS4P35443 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THBS4P35443 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THBS4P35443 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THBS4P35443 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THBS4P35443 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THBS4P35443 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THBS4P35443 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THBS4P35443 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
THBS4P35443 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
THBS4P35443 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THBS4P35443 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THBS4P35443 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THBS4P35443 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THBS4P35443 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms