Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms