Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NF2P35240 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NF2P35240 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NF2P35240 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NF2P35240 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NF2P35240 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NF2P35240 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NF2P35240 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NF2P35240 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NF2P35240 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NF2P35240 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NF2P35240 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NF2P35240 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NF2P35240 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NF2P35240 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NF2P35240 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NF2P35240 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NF2P35240 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NF2P35240 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NF2P35240 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NF2P35240 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NF2P35240 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NF2P35240 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NF2P35240 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NF2P35240 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NF2P35240 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NF2P35240 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NF2P35240 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NF2P35240 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NF2P35240 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NF2P35240 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NF2P35240 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NF2P35240 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NF2P35240 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NF2P35240 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NF2P35240 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NF2P35240 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NF2P35240 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NF2P35240 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NF2P35240 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NF2P35240 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NF2P35240 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NF2P35240 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NF2P35240 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NF2P35240 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NF2P35240 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NF2P35240 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NF2P35240 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NF2P35240 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NF2P35240 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NF2P35240 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NF2P35240 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NF2P35240 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NF2P35240 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NF2P35240 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NF2P35240 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NF2P35240 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NF2P35240 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NF2P35240 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NF2P35240 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NF2P35240 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NF2P35240 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NF2P35240 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NF2P35240 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NF2P35240 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NF2P35240 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NF2P35240 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NF2P35240 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NF2P35240 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NF2P35240 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NF2P35240 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NF2P35240 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NF2P35240 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NF2P35240 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NF2P35240 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NF2P35240 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NF2P35240 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NF2P35240 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NF2P35240 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NF2P35240 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NF2P35240 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NF2P35240 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NF2P35240 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NF2P35240 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NF2P35240 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NF2P35240 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NF2P35240 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NF2P35240 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NF2P35240 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NF2P35240 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NF2P35240 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NF2P35240 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NF2P35240 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NF2P35240 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NF2P35240 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NF2P35240 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NF2P35240 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NF2P35240 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NF2P35240 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NF2P35240 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms