Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG3P32926 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG3P32926 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG3P32926 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG3P32926 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG3P32926 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG3P32926 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG3P32926 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG3P32926 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG3P32926 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DSG3P32926 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DSG3P32926 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DSG3P32926 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DSG3P32926 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DSG3P32926 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DSG3P32926 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG3P32926 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG3P32926 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG3P32926 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG3P32926 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG3P32926 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG3P32926 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG3P32926 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG3P32926 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG3P32926 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG3P32926 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG3P32926 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG3P32926 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DSG3P32926 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DSG3P32926 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DSG3P32926 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DSG3P32926 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DSG3P32926 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DSG3P32926 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DSG3P32926 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DSG3P32926 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DSG3P32926 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DSG3P32926 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DSG3P32926 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DSG3P32926 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DSG3P32926 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DSG3P32926 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DSG3P32926 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DSG3P32926 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DSG3P32926 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DSG3P32926 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DSG3P32926 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DSG3P32926 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DSG3P32926 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DSG3P32926 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DSG3P32926 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DSG3P32926 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DSG3P32926 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DSG3P32926 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DSG3P32926 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DSG3P32926 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DSG3P32926 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DSG3P32926 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DSG3P32926 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DSG3P32926 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG3P32926 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG3P32926 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG3P32926 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG3P32926 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG3P32926 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG3P32926 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG3P32926 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG3P32926 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG3P32926 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG3P32926 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG3P32926 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG3P32926 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG3P32926 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG3P32926 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DSG3P32926 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DSG3P32926 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DSG3P32926 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG3P32926 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG3P32926 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG3P32926 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG3P32926 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG3P32926 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG3P32926 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG3P32926 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSG3P32926 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSG3P32926 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSG3P32926 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSG3P32926 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSG3P32926 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DSG3P32926 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DSG3P32926 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DSG3P32926 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DSG3P32926 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DSG3P32926 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSG3P32926 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSG3P32926 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSG3P32926 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSG3P32926 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DSG3P32926 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DSG3P32926 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms