Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCKBRP32239 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKBRP32239 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms