Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASQ1P31415 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASQ1P31415 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASQ1P31415 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
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