Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK1P30085 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMPK1P30085 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMPK1P30085 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms