Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECHS1P30084 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECHS1P30084 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ECHS1P30084 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms