Protein–RNA interactions for Protein: P29373

CRABP2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP2P29373 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRABP2P29373 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRABP2P29373 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRABP2P29373 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms