Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB2P29033 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB2P29033 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB2P29033 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB2P29033 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB2P29033 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB2P29033 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB2P29033 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB2P29033 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB2P29033 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB2P29033 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB2P29033 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB2P29033 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB2P29033 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB2P29033 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB2P29033 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB2P29033 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB2P29033 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB2P29033 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB2P29033 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB2P29033 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB2P29033 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB2P29033 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB2P29033 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB2P29033 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB2P29033 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB2P29033 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB2P29033 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB2P29033 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB2P29033 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB2P29033 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB2P29033 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB2P29033 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB2P29033 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB2P29033 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB2P29033 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB2P29033 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB2P29033 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB2P29033 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB2P29033 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB2P29033 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB2P29033 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB2P29033 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB2P29033 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB2P29033 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB2P29033 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB2P29033 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB2P29033 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB2P29033 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB2P29033 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB2P29033 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GJB2P29033 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB2P29033 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB2P29033 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB2P29033 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB2P29033 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB2P29033 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB2P29033 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB2P29033 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB2P29033 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB2P29033 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB2P29033 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB2P29033 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB2P29033 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB2P29033 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB2P29033 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB2P29033 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB2P29033 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB2P29033 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB2P29033 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB2P29033 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB2P29033 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB2P29033 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB2P29033 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB2P29033 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB2P29033 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB2P29033 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB2P29033 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB2P29033 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB2P29033 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB2P29033 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB2P29033 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB2P29033 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB2P29033 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB2P29033 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB2P29033 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB2P29033 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB2P29033 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB2P29033 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB2P29033 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB2P29033 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB2P29033 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB2P29033 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GJB2P29033 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GJB2P29033 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB2P29033 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB2P29033 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB2P29033 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB2P29033 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB2P29033 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms