Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4AP27815 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4AP27815 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4AP27815 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4AP27815 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4AP27815 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4AP27815 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE4AP27815 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE4AP27815 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE4AP27815 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE4AP27815 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE4AP27815 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE4AP27815 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4AP27815 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDE4AP27815 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms