Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTX3P26022 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTX3P26022 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTX3P26022 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTX3P26022 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTX3P26022 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTX3P26022 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX3P26022 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX3P26022 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX3P26022 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX3P26022 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX3P26022 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX3P26022 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX3P26022 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX3P26022 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX3P26022 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX3P26022 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTX3P26022 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTX3P26022 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTX3P26022 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTX3P26022 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTX3P26022 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTX3P26022 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTX3P26022 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTX3P26022 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTX3P26022 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTX3P26022 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTX3P26022 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTX3P26022 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTX3P26022 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTX3P26022 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTX3P26022 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTX3P26022 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTX3P26022 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTX3P26022 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTX3P26022 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTX3P26022 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTX3P26022 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTX3P26022 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTX3P26022 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTX3P26022 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTX3P26022 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTX3P26022 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTX3P26022 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTX3P26022 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX3P26022 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX3P26022 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX3P26022 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX3P26022 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX3P26022 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX3P26022 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX3P26022 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX3P26022 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX3P26022 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTX3P26022 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTX3P26022 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTX3P26022 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTX3P26022 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTX3P26022 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTX3P26022 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTX3P26022 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTX3P26022 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTX3P26022 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTX3P26022 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTX3P26022 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTX3P26022 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTX3P26022 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTX3P26022 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTX3P26022 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTX3P26022 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTX3P26022 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTX3P26022 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTX3P26022 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTX3P26022 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTX3P26022 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTX3P26022 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTX3P26022 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTX3P26022 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTX3P26022 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTX3P26022 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTX3P26022 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTX3P26022 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTX3P26022 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTX3P26022 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTX3P26022 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTX3P26022 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTX3P26022 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTX3P26022 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTX3P26022 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTX3P26022 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTX3P26022 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTX3P26022 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTX3P26022 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTX3P26022 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTX3P26022 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTX3P26022 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTX3P26022 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTX3P26022 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTX3P26022 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTX3P26022 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms