Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA2P24043 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA2P24043 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA2P24043 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms