Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRM1P23921 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRM1P23921 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRM1P23921 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RRM1P23921 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRM1P23921 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRM1P23921 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRM1P23921 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRM1P23921 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRM1P23921 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRM1P23921 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRM1P23921 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRM1P23921 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRM1P23921 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRM1P23921 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRM1P23921 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM1P23921 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM1P23921 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM1P23921 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM1P23921 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM1P23921 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM1P23921 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM1P23921 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM1P23921 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM1P23921 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM1P23921 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM1P23921 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM1P23921 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRM1P23921 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRM1P23921 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRM1P23921 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRM1P23921 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRM1P23921 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRM1P23921 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRM1P23921 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRM1P23921 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRM1P23921 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRM1P23921 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRM1P23921 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRM1P23921 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRM1P23921 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRM1P23921 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RRM1P23921 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRM1P23921 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRM1P23921 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRM1P23921 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRM1P23921 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRM1P23921 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRM1P23921 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRM1P23921 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRM1P23921 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRM1P23921 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRM1P23921 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRM1P23921 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRM1P23921 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRM1P23921 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRM1P23921 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRM1P23921 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRM1P23921 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRM1P23921 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRM1P23921 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRM1P23921 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRM1P23921 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RRM1P23921 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRM1P23921 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRM1P23921 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRM1P23921 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRM1P23921 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRM1P23921 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM1P23921 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM1P23921 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM1P23921 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM1P23921 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM1P23921 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM1P23921 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM1P23921 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM1P23921 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM1P23921 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM1P23921 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM1P23921 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM1P23921 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRM1P23921 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRM1P23921 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRM1P23921 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRM1P23921 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRM1P23921 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRM1P23921 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRM1P23921 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRM1P23921 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRM1P23921 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRM1P23921 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRM1P23921 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RRM1P23921 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRM1P23921 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRM1P23921 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRM1P23921 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRM1P23921 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRM1P23921 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRM1P23921 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRM1P23921 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms