Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGA6P23229 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGA6P23229 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms