Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASTP20810 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASTP20810 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASTP20810 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASTP20810 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASTP20810 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASTP20810 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASTP20810 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASTP20810 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CASTP20810 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASTP20810 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASTP20810 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASTP20810 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASTP20810 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASTP20810 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASTP20810 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASTP20810 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CASTP20810 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASTP20810 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASTP20810 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASTP20810 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASTP20810 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASTP20810 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASTP20810 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASTP20810 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASTP20810 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASTP20810 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASTP20810 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASTP20810 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASTP20810 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASTP20810 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASTP20810 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASTP20810 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASTP20810 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CASTP20810 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASTP20810 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASTP20810 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASTP20810 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASTP20810 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASTP20810 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASTP20810 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASTP20810 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASTP20810 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASTP20810 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASTP20810 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASTP20810 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASTP20810 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASTP20810 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASTP20810 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CASTP20810 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASTP20810 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASTP20810 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASTP20810 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASTP20810 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASTP20810 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASTP20810 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASTP20810 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASTP20810 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASTP20810 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASTP20810 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASTP20810 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASTP20810 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASTP20810 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASTP20810 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASTP20810 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASTP20810 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASTP20810 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASTP20810 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASTP20810 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASTP20810 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASTP20810 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASTP20810 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASTP20810 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASTP20810 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASTP20810 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASTP20810 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASTP20810 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASTP20810 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASTP20810 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASTP20810 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CASTP20810 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASTP20810 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASTP20810 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASTP20810 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASTP20810 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASTP20810 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASTP20810 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASTP20810 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASTP20810 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASTP20810 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASTP20810 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASTP20810 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASTP20810 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASTP20810 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CASTP20810 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASTP20810 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASTP20810 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASTP20810 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASTP20810 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASTP20810 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms