Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN3P20807 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN3P20807 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms