Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMY2BP19961 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMY2BP19961 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AMY2BP19961 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms