Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRAP18433 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRAP18433 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRAP18433 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
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