Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARF4P18085 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARF4P18085 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARF4P18085 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARF4P18085 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARF4P18085 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARF4P18085 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARF4P18085 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARF4P18085 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARF4P18085 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARF4P18085 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARF4P18085 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARF4P18085 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARF4P18085 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARF4P18085 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARF4P18085 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARF4P18085 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARF4P18085 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARF4P18085 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARF4P18085 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARF4P18085 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARF4P18085 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARF4P18085 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARF4P18085 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARF4P18085 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARF4P18085 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARF4P18085 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARF4P18085 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARF4P18085 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARF4P18085 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARF4P18085 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARF4P18085 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARF4P18085 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARF4P18085 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARF4P18085 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARF4P18085 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARF4P18085 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARF4P18085 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARF4P18085 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARF4P18085 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARF4P18085 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARF4P18085 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARF4P18085 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARF4P18085 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARF4P18085 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARF4P18085 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARF4P18085 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARF4P18085 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARF4P18085 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARF4P18085 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARF4P18085 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARF4P18085 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARF4P18085 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARF4P18085 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARF4P18085 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARF4P18085 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARF4P18085 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARF4P18085 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARF4P18085 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARF4P18085 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARF4P18085 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARF4P18085 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARF4P18085 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARF4P18085 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARF4P18085 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARF4P18085 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARF4P18085 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARF4P18085 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARF4P18085 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARF4P18085 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARF4P18085 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARF4P18085 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARF4P18085 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARF4P18085 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARF4P18085 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARF4P18085 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARF4P18085 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARF4P18085 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARF4P18085 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARF4P18085 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARF4P18085 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARF4P18085 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARF4P18085 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARF4P18085 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARF4P18085 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARF4P18085 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARF4P18085 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARF4P18085 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARF4P18085 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARF4P18085 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARF4P18085 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARF4P18085 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARF4P18085 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARF4P18085 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARF4P18085 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARF4P18085 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARF4P18085 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARF4P18085 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARF4P18085 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARF4P18085 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms