Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTPS1P17812 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTPS1P17812 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTPS1P17812 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTPS1P17812 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTPS1P17812 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTPS1P17812 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTPS1P17812 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTPS1P17812 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTPS1P17812 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTPS1P17812 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTPS1P17812 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTPS1P17812 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTPS1P17812 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms