Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DESP17661 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DESP17661 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DESP17661 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DESP17661 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DESP17661 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DESP17661 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DESP17661 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DESP17661 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DESP17661 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DESP17661 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DESP17661 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DESP17661 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DESP17661 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DESP17661 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DESP17661 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DESP17661 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DESP17661 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DESP17661 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DESP17661 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DESP17661 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DESP17661 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DESP17661 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DESP17661 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DESP17661 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DESP17661 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DESP17661 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DESP17661 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DESP17661 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DESP17661 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DESP17661 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DESP17661 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DESP17661 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DESP17661 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DESP17661 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DESP17661 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DESP17661 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DESP17661 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DESP17661 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DESP17661 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DESP17661 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DESP17661 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DESP17661 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DESP17661 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DESP17661 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DESP17661 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DESP17661 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DESP17661 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DESP17661 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DESP17661 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DESP17661 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DESP17661 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DESP17661 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DESP17661 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DESP17661 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DESP17661 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DESP17661 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DESP17661 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DESP17661 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DESP17661 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DESP17661 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DESP17661 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DESP17661 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DESP17661 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DESP17661 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DESP17661 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DESP17661 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DESP17661 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DESP17661 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DESP17661 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DESP17661 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DESP17661 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DESP17661 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DESP17661 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DESP17661 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DESP17661 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DESP17661 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DESP17661 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DESP17661 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DESP17661 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DESP17661 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DESP17661 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DESP17661 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DESP17661 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DESP17661 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DESP17661 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms