Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN2P17655 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms