Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA2P17301 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA2P17301 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA2P17301 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA2P17301 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA2P17301 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA2P17301 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA2P17301 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms