Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOT1P17174 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOT1P17174 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOT1P17174 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOT1P17174 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOT1P17174 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOT1P17174 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOT1P17174 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOT1P17174 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOT1P17174 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOT1P17174 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOT1P17174 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOT1P17174 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOT1P17174 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1P17174 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1P17174 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1P17174 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1P17174 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1P17174 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1P17174 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1P17174 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1P17174 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1P17174 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1P17174 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOT1P17174 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOT1P17174 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOT1P17174 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOT1P17174 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOT1P17174 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOT1P17174 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GOT1P17174 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOT1P17174 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOT1P17174 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOT1P17174 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOT1P17174 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOT1P17174 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOT1P17174 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOT1P17174 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOT1P17174 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GOT1P17174 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOT1P17174 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOT1P17174 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1P17174 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1P17174 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1P17174 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1P17174 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1P17174 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1P17174 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1P17174 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1P17174 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1P17174 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1P17174 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOT1P17174 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOT1P17174 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOT1P17174 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOT1P17174 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOT1P17174 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOT1P17174 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOT1P17174 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOT1P17174 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOT1P17174 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOT1P17174 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOT1P17174 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOT1P17174 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOT1P17174 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOT1P17174 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOT1P17174 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GOT1P17174 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1P17174 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1P17174 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1P17174 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1P17174 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1P17174 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1P17174 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1P17174 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1P17174 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOT1P17174 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOT1P17174 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOT1P17174 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOT1P17174 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOT1P17174 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GOT1P17174 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOT1P17174 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOT1P17174 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOT1P17174 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOT1P17174 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOT1P17174 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GOT1P17174 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOT1P17174 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOT1P17174 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOT1P17174 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOT1P17174 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOT1P17174 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOT1P17174 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOT1P17174 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOT1P17174 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOT1P17174 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GOT1P17174 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOT1P17174 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOT1P17174 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms