Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE6AP16499 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE6AP16499 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6AP16499 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms