Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM27P14373 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM27P14373 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM27P14373 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms