Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTN1P12814 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACTN1P12814 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTN1P12814 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms