Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ESRRAP11474 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ESRRAP11474 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ESRRAP11474 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms