Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CALM3P0DP25 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALM3P0DP25 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALM3P0DP25 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms