Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2BP0DI82 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC2BP0DI82 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms