Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T8

TMEM253, Transmembrane protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM253P0C7T8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM253P0C7T8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM253P0C7T8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms