Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC175P0C221 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC175P0C221 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms