Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT19P08727 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT19P08727 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT19P08727 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT19P08727 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT19P08727 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT19P08727 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT19P08727 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT19P08727 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT19P08727 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT19P08727 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT19P08727 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT19P08727 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT19P08727 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT19P08727 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT19P08727 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT19P08727 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT19P08727 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT19P08727 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT19P08727 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT19P08727 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT19P08727 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT19P08727 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT19P08727 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT19P08727 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT19P08727 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT19P08727 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT19P08727 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT19P08727 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT19P08727 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT19P08727 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT19P08727 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT19P08727 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT19P08727 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT19P08727 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT19P08727 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT19P08727 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT19P08727 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT19P08727 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT19P08727 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT19P08727 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT19P08727 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT19P08727 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT19P08727 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT19P08727 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT19P08727 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT19P08727 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT19P08727 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT19P08727 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT19P08727 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT19P08727 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT19P08727 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT19P08727 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT19P08727 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT19P08727 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT19P08727 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT19P08727 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT19P08727 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT19P08727 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT19P08727 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT19P08727 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT19P08727 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT19P08727 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT19P08727 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT19P08727 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT19P08727 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT19P08727 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT19P08727 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT19P08727 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT19P08727 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT19P08727 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT19P08727 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT19P08727 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT19P08727 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT19P08727 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT19P08727 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT19P08727 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT19P08727 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT19P08727 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT19P08727 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT19P08727 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT19P08727 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT19P08727 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT19P08727 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT19P08727 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT19P08727 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT19P08727 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT19P08727 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT19P08727 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT19P08727 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT19P08727 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT19P08727 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT19P08727 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT19P08727 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT19P08727 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT19P08727 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT19P08727 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT19P08727 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT19P08727 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT19P08727 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms