Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTMAP06454 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTMAP06454 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTMAP06454 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTMAP06454 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTMAP06454 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTMAP06454 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTMAP06454 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTMAP06454 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTMAP06454 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTMAP06454 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTMAP06454 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTMAP06454 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTMAP06454 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTMAP06454 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTMAP06454 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTMAP06454 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTMAP06454 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTMAP06454 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTMAP06454 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTMAP06454 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTMAP06454 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTMAP06454 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTMAP06454 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTMAP06454 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTMAP06454 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTMAP06454 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTMAP06454 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTMAP06454 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTMAP06454 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTMAP06454 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTMAP06454 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTMAP06454 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTMAP06454 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTMAP06454 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTMAP06454 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTMAP06454 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTMAP06454 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTMAP06454 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTMAP06454 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTMAP06454 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTMAP06454 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTMAP06454 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTMAP06454 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTMAP06454 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTMAP06454 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTMAP06454 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTMAP06454 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTMAP06454 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTMAP06454 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTMAP06454 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTMAP06454 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTMAP06454 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTMAP06454 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTMAP06454 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTMAP06454 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTMAP06454 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTMAP06454 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTMAP06454 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTMAP06454 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTMAP06454 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTMAP06454 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTMAP06454 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTMAP06454 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTMAP06454 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTMAP06454 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTMAP06454 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTMAP06454 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTMAP06454 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTMAP06454 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTMAP06454 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTMAP06454 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTMAP06454 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTMAP06454 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTMAP06454 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTMAP06454 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTMAP06454 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTMAP06454 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTMAP06454 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTMAP06454 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTMAP06454 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTMAP06454 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTMAP06454 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTMAP06454 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTMAP06454 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTMAP06454 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTMAP06454 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTMAP06454 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTMAP06454 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTMAP06454 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTMAP06454 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTMAP06454 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTMAP06454 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTMAP06454 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTMAP06454 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTMAP06454 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTMAP06454 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTMAP06454 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTMAP06454 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTMAP06454 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms