Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCGP05129 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCGP05129 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms